荔枝根系因苗木繁殖方法不同而異。實生樹及嫁接樹有發(fā)達的主根；高壓（圈枝）繁殖的荔枝側(cè)根須根發(fā)達，沒有主根。荔枝的根系由很多粗壯發(fā)達的側(cè)根和纖細(xì)茂密的細(xì)根所組成，初生的幼根白色，肉質(zhì)，質(zhì)脆易斷，俗稱“豆芽根”。

老根呈灰褐色。荔枝根系與真菌共生，形成菌根，為總狀分枝式。不同品種，樹表皮的色澤和糙度有差異。水東黑葉、大造等品種的樹干灰白色，表皮較光滑，黑葉、糯米糍、禾荔等品種，樹干黑褐色，表皮較粗糙。

一個小花組一般由三個花蕾組成，品字形排列，二個小花組和中間一個單花蕾即七個花蕾構(gòu)成一個花組。有些大穗型的花穗還由二個花組和中間一個單花蕾，即15個花蕾組成一個大花組。一般2～7個花組（或大花組）構(gòu)成一個支穗。