醫(yī)院排出的放射性廢水常用貯存衰減法處理。醫(yī)院常用的放射性同位素如131碘,32磷,198金，24鈉等是半衰期較短的同位素，因此可以將放射性污水貯存于地下衰變水池內,貯存時間為10倍于半衰期,把放射性濃度降到容許排放的程度。如果放射性污水的濃度很低，水量很小，也可用稀釋法處理。中國的《放射性防護規(guī)定》要求每一微居里放射性同位素達到容許排放濃度需稀釋水量1.67米3。當放射性污水濃度很高,放射性的半衰期很長，不宜用貯存法和稀釋法處理時，可用蒸發(fā)法、離子交換法或凝聚沉淀法進行分離濃縮處理（見放射性廢水處理）。

傳染病醫(yī)院的污水和糞便宜分別收集。生活污水直接進入預消毒池進行消毒處理后進入調節(jié)池，病人的糞便應先立消毒后，通過下水道進入化糞池或單處理（如虛線所示）。各構筑物須在密閉的環(huán)境中運行，通過統(tǒng)一的通風系統(tǒng)進行換氣，廢氣通過消毒后排放，消毒可采用紫外線消毒系統(tǒng) 好氧生化處理單元去除CODcr、BOD5等有機污染物，好氧生化處理可選擇接觸氧化、活性污泥和好氧處理工藝，如膜生物反應器、曝氣生物濾池等工藝。采用具有過濾功能的好氧處理工藝，可以降低懸浮物濃度，有利于后續(xù)消毒。 適用于傳染病醫(yī)院(包括帶傳染病房的綜合醫(yī)院)和排入自然水體的綜合醫(yī)院處理。

根據國家環(huán)?？偩值挠嘘P規(guī)定（國家環(huán)?？偩?醫(yī)院污水處理技術指南.2003.12（環(huán)發(fā)（2003）197號 ），將各類醫(yī)院按性質分為綜合醫(yī)院和傳染病醫(yī)院兩類，與衛(wèi)生系統(tǒng)對醫(yī)院及醫(yī)療機構的劃分方法有差別。其中傳染病醫(yī)院指傳染性疾病?？漆t(yī)院和帶傳染病房的綜合醫(yī)院，綜合醫(yī)院為不帶傳染病房的綜合醫(yī)院和各類非傳染性疾病的?？漆t(yī)院。醫(yī)院污水凈化包括綜合醫(yī)院、中醫(yī)醫(yī)院、中西醫(yī)結合醫(yī)院、民族醫(yī)院和?？漆t(yī)院（傳染病醫(yī)院（包括結核病院）、心血管病醫(yī)院、腫瘤醫(yī)院、口腔醫(yī)院、婦產科醫(yī)院和精神病醫(yī)院等等）各類醫(yī)院污水的處理，同時也包括療養(yǎng)院、康復醫(yī)院等其它醫(yī)療機構和獸醫(yī)院的污水處理工程。