轉(zhuǎn)錄因子ChIP-seq整體服務(wù)
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轉(zhuǎn)錄因子ChIP-seq整體服務(wù)
發(fā)布時間:2017-09-13 09:40:24 | 瀏覽次數(shù)：
項目簡介
基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控是生物基因表達調(diào)控層次中關(guān)鍵的一層，而轉(zhuǎn)錄因子是參與基因表達調(diào)控的一類重要的細胞核蛋白質(zhì)。轉(zhuǎn)錄因子通過特異性結(jié)合調(diào)控區(qū)域的DNA序列來調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄過程，因此在全基因組水平將轉(zhuǎn)錄因子定位于靶基因DNA是認識轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的有效方法之一。
通過轉(zhuǎn)錄因子ChIP-Seq技術(shù)能夠揭示轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點和確定直接的靶基因序列，可在體內(nèi)分析特定啟動子的分子調(diào)控機制。ChIP-Seq已廣泛應(yīng)用于研究一些經(jīng)典轉(zhuǎn)錄因子和一些新的轉(zhuǎn)錄因子在全基因組上的結(jié)合情況，實現(xiàn)全基因組層面分析一些經(jīng)典的轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，或為新轉(zhuǎn)錄因子的功能研究提供一些線索。
表觀生物技術(shù)團隊具備豐富的ChIP實驗經(jīng)驗，利用經(jīng)驗證的ChIP級抗體，提供轉(zhuǎn)錄因子共沉淀服務(wù)，并結(jié)合新一代高通量測序技術(shù)，為生物醫(yī)學(xué)研究人員提供轉(zhuǎn)錄因子研究整體服務(wù)（ChIP-seq）。
項目流程 ：
樣本要求：
人及大鼠或小鼠細胞
細胞量達到107個
組織樣本需評估
測序模式：
SE50
測序數(shù)據(jù)量：
20M
生物信息分析內(nèi)容
一、標準信息分析
1. 去接頭污染，去低質(zhì)量reads和測序質(zhì)量評估
2. ChIP測序序列與參考基因組序列的比對
3. ChIP測序reads在全基因組的分布
4. Peak鑒定及基因原件分析
5. Peak相關(guān)基因篩選與GO功能聚類分析、Pathway分析
二、信息分析
可根據(jù)客戶的需求，定制信息分析內(nèi)容。
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